عنوان پایان نامه

پیشنهادات پژوهش

تولید فیوژن پروتئین از قطعات ‌اپی‌توپی توکسین بتا و اپسیلون Clostridium perfringens

 بیان فیوژن پروتئین در سایر سیستم‌های بیانی
2. استفاده از فیوژن پروتئین یا آنتی بادی حاصل از آن در کیت‌های تشخیصی مرتبط
3. تزریق فیوژن پروتئین به خرگوش یا حیوانات بزرگ‌تر و بررسی آنتی بادی حاصل از آن
4. بررسی توانایی فیوژن پروتئین در واکسیناسیون حیوانات در برابر دوز مرگ آور اپسیلون و بتا توکسین

جداسازی و شناسایی باکتری های مولد کیتیناز از ناحیه جنوبی دریای خزر

  آنزیم مورد نظر به طور کامل خالص شود و عوامل مختلف بر تولید آن مورد بررسی قرار گیرد.
2- اثرات ضد قارچی آن مورد بررسی قرار گیرد.
3- می توان با شناسایی ژن کیتیناز و کلونینگ آن، به میکروارگانیسم های نوترکیبی با توانایی بالای تولید آنزیمی دست یافت.
4- ساختار سه بعدی و توالی آمینواسیدی آن مورد بررسی قرار گیرد.
5- سویه های بررسی شده، مورد شناسایی کامل قرار گیرند
6- با توجه به کاربرد زیاد N-استیل دی گلوکز آمین، خصوصا در پزشکی، کاربرد های آن مورد بررسی قرار گیرد.

شناسایي گنجشک سانان حوزه ی آبریز کارده با استفاده از ژن میتوکندریایي

استفاده از سایر ژن های میتوکندریایی و یا ژن های هسته ای در بررسی های مولکولی و مقایسه نتایج حاصل
2- مطالعه و بررسی کامل تر گونه های دارای تغییرات بیش از حد آستانه؛
3- مطالعه و بررسی جامع تر روابط فیلوژنتیکی راسته گنجشک سانان.

بررسی پتانسیل رنگبری بعضی از انواع رنگ  های آزو توسط سویه  هایputida F1 Pseudomonas و  Pseudomonas  fluorescens 101

جداسازی سویه  های سازگار از پساب کارخانجات نساجی و بررسی فعالیت رنگبری آن  ها
2- بررسی فعالیت رنگبری دو سویهF1  P. putida و101 P.fluorescens  بر سایر رنگ-های آزو
3- بررسی فعالیت رنگبری رنگ  های آزو توسط سویه  های بومی ایران
4- ساخت دستگاه تجزیه زیستی پساب کارخانجات نساجی توسط میکروارگانیسم  ها و استفاده از آن در سیستم تصفیه پساب صنایع
5- استفاده از روش تجزیه زیستی رنگ  های آزو و آلاینده  های محیطی در صنایع به جای روش-های نا امن فیزیکو شیمیایی
6- ارتقاء بخشی قدرت رنگبری سویه های بومی با دستکاری های ژنتیکی

بررسی آرایه شناختی گونه سارگپه پا بلند Buteo rufinus
با استفاده از داده های ژن میتوکندریایی  COX1 و داده های ریخت شناسی

با توجه به عنوان شدن مربوط بودن تغییرات رنگی به سن در منابع مختلف (Ferguson et al. 2001)، Heinzel‎ et al, 1995)) و(کابلی و همکاران، 1390)، بررسی دقیق دوره زاد آوری این گونه می تواند در روشن شدن ابهامات مربوط به تغییرات محسوس پر آرایی در این گونه سهم به سزایی داشته باشد.
استفاده از ژن های میتوکندریایی و هسته ای دیگر با توانایی تشخیص دقیق تر برای جنس  Buteoمیتواند در نشان دادن جایگاه تغییرات ظاهری از قبیل پر آرایی (plumage) که در تشخیص گونه های مختلف پرندگان اهمیت کاربردی بالایی دارد، موثر باشد.
دلایل ایجاد مورف های رنگی متفاوت به صورت هم جا و خواستگاه زیستی یا مزیت های زیستی ایجاد این تغییرات و همچنین خواستگاه ژنتیکی این تغییرات می بایست مورد مطالعه و بررسی دقیق تر قرار بگیرد.
با توجه به مشکلات مطرح شده برای جنس Buteo بررسی مولکولی و ریخت شناسی خانواده قوشیان در ایران و در صورت امکان افغانستان و پاکستان، جهت مقایسه با نمونه های پالئارکتیک و مشخص شدن وضعیت آرایه شناسی گونه ها و جنس های این خانواده مفید فایده خواهد بود.

بررسی اثر بیهوشی مکرردوران نوزادی توسط تیوپنتال بر قابلیت یادگیری قبل و بعد از بلوغ در موش صحرایی ویستار

 استفاده از مدل های حیوانی دیگر برای سنجش یادگیری و حافظه.
2-  با توجه به اینکه جمعیت های نورونی در زمان های متفاوتی تکوین می یابند، با مصرف  تیوپنتال  در دوران بارداری، در زمان های مختلف میتوان دیگر عوارض جانبی تیوپنتال از جمله بی خوابی، اضطراب و بی قراری در جنین و نوزادرا بررسی کرد.
3- تاثیر تیوپنتال بر حافظه را با روش های  دیگر از جمله ماز مرتفع، ماز شعاعی و شاتل باکس بررسی کرد.
4- اثر سایر مواد بی هوشی بر حافظه

بررسی اثر سمیت سلولی و ضد سرطانی ترکیب کومارینی 5-farnesyloxycoumarin به عنوان مهارکننده آنزیم 15-lipoxygenase-1 در سلول  های سرطان پروستات

در این پژوهش از روش  های مختلفی جهت بررسی سمیت سلولی ترکیب 5f استفاده شد. اما از آن-جا که روش  هایی نظیر comet و رنگ آمیزی DAPI برای تایید القاء آپوپتوز کافی نیستند، لذا جهت بهبود فرآیند مطالعه این ترکیب و اثبات مکانیسم عمل آن بر روی سلول  ها، روش  های دیگری نیز مورد نیاز می  باشند. همچنین احتمال خطا در آزمون  های به  کار رفته در این پژوهش همچون آزمون MTT، نیاز به روش  های جدید و دقیق  تر را دوچندان می  کند. بر این اساس، با توجه به کوتاه بودن زمان انجام پژوهش، پیشنهادهایی در  راستای ارتقاء کارهای تحقیقاتی آینده ارائه می  گردد:
1. تغییر ترکیب 5f به صورتی که قابل انحلال در آب بوده و نیازی به حلال سمی DMSO نداشته باشد.
2. بررسی اثر هم  افزایی ترکیب 5f با داروهای مورد استفاده در شیمی درمانی نظیر cisplatin، vincristine و ... .
3. بررسی سمیت سلولی ترکیب 5f بر روی دیگر رده  های سلول  های سرطانی بویژه سرطان  های شایع همچون سرطان پستان، کولون و معده.
4. بررسی تاثیر این ترکیب بر تغییر بیان آنزیم 15-LOX-1 با روش RT-PCR در سلول  های سرطانی.
5. بررسی اثرات ضد توموری ترکیب 5f در شرایط in vivo.
6. بررسی تغییر بیان ژن  های دخیل در آپوپتوز  (در سطح رونویسی) نظیر BCL2، BAX، P53.
7. استفاده از تکنیک Western blot جهت بررسی پروتئین  های مختلف درگیر در آپوپتوز.
8. بررسی بیان ژن  های دخیل در مسیرهای متابولیسمی آنزیم 15-LOX-1 نظیر MAPK، PPAR-γ و ... پس از تیمار با 5f بواسطه روش  های Real time-PCR و Western blot.

بررسی اثرات تجویز اینترفرون  های نوع یک (آلفا وبتا) و فاکتور محرک رشد کلونی گرانولوسیت  ها (G-CSF) برسطوح سرمی برخی از شاخص های بیوشیمیایی در خون موش سوری 

به دلیل اینکه تغییرات به وجود آمده در فاکتورهای خونی شدید بودند و احتمالاً اثرات مضر بیولوژیکی در پی خواهند داشت پیشنهاد می  شود برای یافتن دوز مناسب، آزمایش با دوز  های کمتر تکرار شود.
ب) برای بررسی اثر سینرژیک G-CSF با IFN-α و  IFN-βتحقیقات گسترده  تر انجام شود.
ج) در این گونه آزمایش  ها در بررسی  های هیستولوژیک کبد، درجه بندی التهاب لحاظ شود تا بهتر بتوان میزان التهاب و ارتباط آن با سطوح سرمی آنزیم  های کبدی را مطالعه کرد.

بررسی اثرات سمیت سلولی و ضد سرطانی ترکیب کومارینی umbelliprenin به عنوان مهار کننده آنزیم 15-Lipoxygenase-1 در رده سلولی PC-3

 انجام آزمون MTT بر روی سلول‌های PC-3 و HFF3 پس از تیمار با داروهای رایج ضد سرطان از جمله cisplatin، doxorubicin و paclitaxel و مقایسه نتایج با umbelliprenin.
2- بررسی خاصیت مهار فعالیت آنزیمی ماده umbelliprenin در دیگر رده‌های سلولی سرطانی پروستات از جمله LNCap.
3- بررسی فعالیت آنزیم 15-LOX-1 در رده سلولی طبیعی HFF3 و نیز سلول‌های طبیعی پروستات.
4- بررسی سمیت سلولی ماده umbelliprenin در سلول‌های طبیعی پروستات.
5- بررسی سمیت سلولی ماده umbelliprenin در دیگر رده‌های سرطانی پروستات از جمله سلول‌های LNCap
6- انجام آزمون comet در سلول‌های طبیعی HFF3 پس از تاثیر غلظت‌ g/mlµ 13 ماده 4-MMPB (غلظت IC50 ماده 4-MMPB بر روی رده PC-3) و مقایسه آن با umbelliprenin.
7- استفاده همزمان از رنگ‌آمیزی PI و Annexin V برای تشخیص دقیق سلول‌های آپوپتوزی و نکروزی پس از تیمار با umbelliprenin.
8- بررسی بیان پروتئین‌های آپوپتوزی پس از تیمار با umbelliprenin با استفاده از وسترن بلات.
9- بررسی آسیب به DNA سلولی پس از تیمار با ماده به روش DNA Laddering.
10- اندازه گیری مقادیر ROS با استفاده از رنگ فلورسنت DCF-DA پس از تیمار با ماده در سلول‌های PC-3 و ...
11- بررسی بیان ژن‌های دخیل در مسیر متابولیسمی 15-LOX-1 مانند PPAR-γ، MAP Kinase ، IGF-1R و ... پس از تیمار با umbelliprenin با استفاده از روش Real time PCR و وسترن بلات.

بررسي اثرات سميت سلولي و ضدسرطاني تركيب کومارینی
6-farnesyloxycoumarin به  عنوان مهارکننده آنزیم 15-lipoxygenase-1
بر روی سلول  های سرطان پروستات

جام سنجش MTT بر روی سلول‌های PC-3 و HFF3 پس از تیمار با داروی ضد سرطان cisplatin و یا داروهای مشابه.
2- بررسی خاصیت سمیت سلولی و مهار فعالیت آنزیمی ماده 6fدر دیگر رده‌های سلولی سرطانی پروستات از جمله LNCaP.
3- انجام فلوسیتومتری با استفاده از رنگ‌آمیزی PI و Annexin V برای تشخیص دقیق سلول‌های آپوپتوزی و نکروزی پس از تیمار با 6f.
4- بررسی مقایسه ای بیان ژن های دخیل در آپوپتوز به روش .RT-PCR
5- بررسی بیان پروتئین‌های آپوپتوزی پس از تیمار با 6f با استفاده از وسترن بلات.
6- بررسی فعالیت آنزیمی 15-LOX-1در سلول  های HFF3 و سلول  های طبیعی بافت پروستات.
7- بررسی اثرات ضد سرطانی ترکیب 6f بر روی رده  های سلولی دیگر و در شرایط .in vivo
8- بررسی بیان ژن  های دخیل در مسیرهای متابولیسمی آنزیم 15-LOX-1 نظیر MAPK وPPAR-γ پس از تیمار با 6f با استفاده از روش  های Real time-PCR و Western blot.

بررسی اثرتجویز نخاعی ویتامین K2 (Menaquinone) بر درد حرارتی و شیمیایی در موش صحرایی نژاد ویستار

 اندازه  گیری فعالیت و بیان آنزیم NOS در حضور ویتامین K2
2. بررسی اثر ویتامین K2 بر کانال  های کلسیمی وابسته به ولتاژ نوع L  و T دخیل بر درد
3. استفاده از آگونیست و آنتاگونیست  های گیرنده  های گلوتاماتی همراه با ویتامین K2 به منظور بررسی اثر مستقیم ویتامینK2 روی این گیرنده  ها
4. اثرات ویتامینK2 با دوزهای متفاوت در میزان و شدت رهاسازی میانجی  های دخیل بر درد مانند، گابا، استیل کولین ،CGRP و التهاب همانند هیستامین و نوروکینین در سطح نخاع
5. مطالعه اثر تجویز نخاعی مزمن ویتامینK2 بر روی درد و مقایسه آن با تجویز حاد

بررسی امکان تشخیص باکتری  های متعلق به گونهSalmonella enterica  زیرگونهenterica  با روش PCR و الکتروفورز با شیب دمایی (TTGE)

جستجو در توالی  های تک کپی دیگر که در بین سروتایپ  های متعلق به زیرگونه enterica دارای تفاوت نوکلئوتیدی بیشتری باشد،
2- تایید اختصاصیت آغازگرهای salF و salR توسط تعداد بیشتری از باکتری  ها،
3- از تعداد بیشتری باکتری  های استاندارد متعلق به زیرگونه enterica جهت کامل کردن "diversity ladder" استفاده شود،
4- بررسی تفکیک باکتری  های استاندارد مورد استفاده در این مطالعه با روش PCR و الکتروفورز با شیب مواد دناتوره کننده شیمیایی (PCR-DGGE)،
5- استفاده از یک روش استخراج DNA آسان و ارزان که نیاز به مرحله پیش   غنی  سازی نمونه غذایی را برطرف نماید،
6- بررسی مواد غذایی که احتمال آلودگی بیشتری با باکتری Salmonella داشته باشند،
7- تلقیح چندین سروتایپ Salmonella در ماده غذایی و مقایسه الگوی حرکتی PCR-TTGE  حاصل با گونه  های استاندارد،
8- انجام آزمایش  های سروتایپینگ به همراه روش مولکولی PCR-TTGE،
9- بررسی اثر بازه  های زمانی مختلف در مرحله پیش غنی  سازی،
10- تعیین مقدار دقیق CFU/ml از باکتری به کمک روش  های کشت،
11- استفاده از روش TTGE بهینه  سازی شده در این مطالعه جهت بررسی حضور باکتری  های متعلق به زیرگونه enterica در نمونه  های بیمارستانی و محیطی.

بررسی امکان تشخیص حضور گونه  های متعلق به جنس Staphylococcus در مواد غذایی با روش PCR-TTGE

 تایید اختصاصیت آغازگر  های TStaG به وسیله  ی تعداد بیشتری از باکتری  ها.
2- بررسی اثر بازه  های زمانی مختلف در مرحله  ی پیش غنی  سازی مواد غذایی تلقیح شده و انتخاب بازه  ی مناسب جهت دست  یابی به بهترین نتیجه در کم  ترین زمان ممکن.
3- تعیین مقدار دقیق CFU/ml از باکتری به کمک روش  های کشت جهت تعیین حساسیت PCR.
4- استفاده از PCR با چرخه  ی کم  تر یا تعداد CFU/ml پایین  تر از باکتری تلقیح شده به ماده  ی غذایی به  منظور مقایسه  ی اثر محیط پیش   غنی  سازی.
5. بررسی طیف وسیع  تر مواد غذایی جهت تایید کارآمد بودن روش PCR-TTGE در شناسایی گونه-های Staphylococcu
6. تهیه  ی تعداد بیشتری گونه  ی استاندارد Staphylococcus و کامل  تر کردن مارکر باکتریایی در ژل TTGE جهت تشخیص جمعیت  های باکتریایی مخلوط در مواد غذای..
 
7. مخلوط نمودن DNA مربوط به گونه  های استاندارد متفاوت Staphylococcus با نسبت  های مختلف و انجام PCR-TTGE
8. تلقیح چندین گونه  ی Staphylococcus به ماده  ی غذایی، استخراج DNA، تکثیر ژن tuf با PCR و مقایسه  ی الگوی حرکتی TTGE حاصل با گونه  های استاندارد.
9. تشخیص گونه  های Staphylococcus، بر اساس مقایسه    ی نمونه با الگوی استاندارد در ژل TTGE، استخراج قطعات مورد نظر از ژل، تکثیر مجدد آن  ها و تایید نهایی با توالی  یابی.
10. خریداری گونه  های استاندارد S. intermedius، S. pseudintermedius و S. delphini از بانک میکروبی و مقایسه  ی الگوی حرکتی آن  ها در TTGE.
11. توالی  یابی دو طرفه  ی ماده  ی غذایی جهت شناسایی مطمئن  تر.
12. مقایسه  ی نتایج مربوط به شناسایی بر اساس روش کشت و شناسایی مستقیم گونه  های باکتریایی در ماده غذایی با روش PCR-TTGE و تعیین گونه  های غیر قابل کشت و نیز گونه  های جدید احتمالی.
13. مطالعه  ی تنوع جمعیت گونه  ای Staphylococcus در طول فرایند تخمیر محصولات گوشتی با روش PCR-DGGE/TGGE
14. بررسی توانایی تولید انتروتوکسین توسط گونه  های Staphylococcus موجود در نمونه    ی مورد نظر با کمک روش  های آنزیمی مانند ELISA ویا روش  های PCR مبتنی بر ژن  های انتروتوکسین.
15. بررسی الگوی مقاومت آنتی  بیوتیکی در نمونه  ی دارای گونه  های Staphylococcus با استفاده از روش  های کشت و یا روش  های PCR مبتنی بر ژن  های مقاومت آنتی  بیوتیکی.

بررسی امکان ریزازدیادی و کشت سوسپانسیون سلولی گیاه نوروزک (Salvia leriifolia Benth.)  و تولید اسیدهای فنولیک در محیط in vitro

شناسایی سایر اسید های فنولیک در عصاره برگ و ریشه گیاه نوروزک؛
2- بررسی تأثیر الیسیتورهای مختلف بر تولید اسید های فنولیک در کشت سوسپانسیون سلول گیاه نوروزک؛
3- بررسی تأثیر الیسیتورهای مختلف بر بیان ژن آنزیم های تنظیم کننده در مسیر بیوسنتز اسید های فنولیک؛
4- بررسی و مقایسه بیان ژن آنزیم های تنظیم کننده در مسیر بیوسنتز اسید های فنولیک و مسیر بیوسنتز لیگنین ها به منظور افزایش شارش مسیر بیوسنتز اسید های فنولیک؛
5- کلونینگ ژن آنزیم های آنزیم های  مسیر فنیل پروپانوئیدی و مسیر مشتق از تیروزین به منظور تعیین عملکرد ژن های مذکور؛

بررسی بافتي و تغييرات سطوح ماركرهاي عملكردي كبد در گوسفندان نر منطقه آلوده به آرسنيك ارغش نیشابور

اگر چه تمامی نمونه های کبدی جمع آوری شده از نظر سلامت ظاهری مورد تأییدکارشناس بهداشت اداره دامپزشکی شهرستان بوده ولی بهتر بود تمامی سرم ها از نظر وجود یا عدم وجود هپاتیت B مورد بررسی قرار می گرفت . استفاده از کیت های آزمایشگاهی  مخصوص گوسفند می تواند میزان خطا را در بررسی های کلینیکی کاهش دهد . آرسنیک ، علاوه بر کبد بطور بالقوه می تواند باعث اختلال در اندامهای دیگر از جمله کلیه ، ریه و ... نیز شود . تأیید این اختلالات در اندامهای دامهای منطقه ، می تواند حساسیت مسئولین ذیربط را نسبت به رفع آلودگی از منطقه بیشتر کند .

بررسی بیان تعدادی از ژن‌های lincRNA مربوط به پلوری‌پوتنسی در
رده سلول‌های تراتوکارسینومایP19

بررسی ارتباط متقابل LincRNAs با فاکتور‌های مربوط به پلوری‌پوتنسی  با تاکید بر اثر این توالی‌ها بر پروموتر فاکتور‌های رونویسی
2- بررسی ارتباط LincRNAs‌ با اجسام هسته‌ای به عنوان یکی از اجزای  اصلی شرکت‌کننده در پلوری‌پوتنسی
3- بررسی آرایش کروماتینی LincRNA  در سلول‌های تمایزیافته و پلوری‌پوتنت
4- بررسی پروتئین‌های متصل به این توالی‌ها
5- بررسی توالی‌های LincRNA در سلول‌های PGC
6- بررسی دیگر LincRNAs در سلول‌های زایای رویانی
7- آنالیز‌های بیوانفورماتیکی ژنوم پستانداران جهت یافتن توالی‌های LincRNA
8- بررسی و مقایسه توالی‌های LincRNA در سلول‌های سالم و سرطانی انسانی
9- بررسی بیان LincRNA‌های مربوط به پلوری‌پوتنسی در  سلول‌های P19 تیمار شده با DMSO

بررسی بیش بیان ژن PAX6(5a) انسانی در سلول‌های بنیادی مزانشیمی استحصال شده از بافت چربی انسانی و بررسی چگونگی تمایز آنها به سلول‌های عصبی شبکیه در شرایط in vitro

بررسی سایر روش‌های تمایزی مانند استفاده از فاکتورها، هورمون ها، ریز مولکول‌ها و miRNA
2- پیوند سلول‌های تمایز یافته به مدل حیوانی و بررسی آنها از لحاظ عملکردی بودن در شرایط in vivo
3- انجام آزمون‌های تکمیلی بر روی سلول‌های تمایز یافته، مانند آزمون فاگوسیتوز برای سلول‌های RPE و یا پاسخ سلول‌های گیرنده نوری به پیام‌های نوری
4-  بررسی سایر نشانگرهای مربوط به سلول های عصبی شبکیه و سلول های RPE مانند OTX، CD73، Mitf، brn3 و ..
5-  بررسی تمایز سایر انواع سلول‌های بنیادی مانند سلول‌های iPS به سلول‌های شبکیه
6- بررسی نشانگرهای سلول های تمایز یافته در سطح بیان پروتئین
7- بررسی روش های جداسازی سلول های تمایز یافته از سلول های بنیادی تمایز نیافته جهت پیوند

بررسی بیوسیستماتیکي خانواده عنکبوت های زمینی در شهرستان سرخس          (Aranei: Gnaphosidae)

از آن جا که تعداد زیادی از نمونه ها در هر نمونه برداری، نابالغ اند و نمی توان از صفات ژنیتالیایی آن ها به منظور شناسایی در سطح گونه استفاده کرد و از طرفی ممکن است بعضی از این صفات شاخص در نمونه های بالغ در حین نمونه برداری از بین رفته باشد و شناسایی این نمونه ها به وسیله مطالعات ریخت شناسی دیگر ممکن نباشد، انجام مطالعات تکمیلی و مولکولی بر پایه ژن CO1 در خانواده عنکبوت های زمینی پیشنهاد میشود.
2- با توجه به تنوع بالای خانواده عنکبوت های زمینی و از آنجا که در ایران تا پیش از مطالعه حاضر مطالعاتی به طور انحصاری بر روی فون این خانواده صورت نگرفته است، پیشنهاد می شود که در سایر نقاط ایران به خصوص نقاط مرزی، مطالعات لازم صورت پذیرد.
3- گردآوری یک کلید شناسایی کامل برای خانواده عنکبوت های زمینی در ایران نیز از موارد ضروری می باشد.

بررسی تاثير تجويز سيستميك و نخاعي عصاره آبي و هيدروالكلي پولپ انار
(Punica granatum) بر درد حرارتي و شيميايي و ادم التهابي پاي موش صحرايي

 جداسازی ترکیبات مختلف عصاره هیدروالکلی به خصوص ترکیبات فنولیکی و بررسی تاثیرات ضد دردی این ترکیبات

ü اندازه گیری غلظت نوروترانسمیتر هایی مانند SP و CGRP در مرکز(نخاع) و محیط (بافت) پس از القاء درد شیمیایی (5 و 25 دقیقه بعد از تجویز فرمالین به کف پا) در حضور و عدم حضور عصاره هیدروالکلی پولپ و پوست انار

ü اندازه گیری غلظت باقی سیتوکاین ها مانند IL-6 , IL-8 ، میزان NO و ROS در مرکز (نخاع) و محیط (بافت) پس از القاء درد شیمیایی (5 و 25 دقیقه پس از تجویز فرمالین به کف پا ) در حضور و عدم حضور عصاره هیدروالکلی پولپ و پوست انار

ü بررسی تداخل اثر عصاره هیدروالکلی پوست و پولپ با سیستم های نوروترانسمیتری تحریکی و مهاری در مطالعات رفتاری و مطالعات الکتروفیزیولوژیک

بررسي تنوع ژنتيكي ارس (Juniperus polycarpos K.Koch)
در شمال  شرق ایران

مطالعه تک  بوم  شناسی گونه  ی ارس استان خراسان به منظور آشکارسازی استراتژی  های تجدید حیات این گیاه با ارزش و شناسایی بیشتر آن برای معرفی استراتژی  های حفاظتی مناسب.
ü مطالعه فلورستیک منطقه   کردینه
ü مطالعه جامع سیستماتیک همتافت Juniperus excelsa با استفاده از نشانگرهای مختلف در تمامی نقاط ایران.
ü مطالعه تجدید نظر در روابط خویشاوندی و تعداد گونه  های جنس Juniperus در ایران.
ü مطالعه کاریولوژیک و استفاده از نشانگرهایی که توانایی شناخت پلی  پلوئیدی را دارند برای تایید دورگه  گیری در  جمعیت شکراب.
ü مطالعه فیلوژئوگرافی Juniperus excelsa در ایران و با استفاده از نشانگر  های کلروپلاستی.
ü مطالعه جمعیت  های Juniperus excelsa در جنوب  شرقی ایران (منشا آن ها به  نظر نامشخص است).
ü مطالعه تک بوم شناسی، جمعیت  شناسی و تنوع ژنتیکی گونه Juniperus communis در ایران
ü مطالعه سیستماتیک و فیلوژئوگرافی Juniperus communisهای ایران
ü مطالعه سیستماتیکی ارس  های غربی ایران برای شناسایی گونه  های آن منطقه
ü بررسی گونه  های دیگر در فلور ایران توران که از مدیترانه منشا گرفته  اند و شرایط مشابهی را با این گیاه دارند، برای تایید ورود از دو جبهه به درون ایران.
ü آزمایش نشانگر  های ریزماهواره متعدد برای پیدا  کردن نشانگرهایی که در گونه  ی Juniperus excelsa در خراسان می  روید، برای مشخص  شدن وضعیت تنوع ژنتیکی این گیاه.
ü مطالعه  های تنوع ژنتیکی سایر گیاهان در معرض خطر در استان خراسان
ü مطالعه سیستماتیکی و تنوع ژنتیکی بازدانگان ایران

بررسی صفات ریخت شناسی و رفتاری در تشخیص عنکبوت  های بیوه سیاه جنسLatrodectus  ( (Araneae: Theridiidae

 با توجه به گستردگی و پیچیدگی مباحث رفتاری به ویژه رفتار تارتنی در عنکبوت  ها، پیشنهاد می  شود هر یک از رفتارها به صورت جداگانه مورد بررسی قرار گیرد.
- بررسی تأثیر تغییرات محیطی بر هریک از رفتارهای مورد مطالعه
- انجام مقایسات ریخت  شناسی دستگاه تارتنی گونه  های مورد مطالعه با استفاده از میکروسکوپ الکترونی
- به منظور دستیابی به تصاویر سه بعدی از این نوع تارها به طور همزمان از دو دوربین استفاده شود.
- مطالعه  ی سایر رفتارها از جمله تخم گذاری، پوست  اندازی و ...

بررسي مقايسه اي بيان ژن WDR5 در سلول  هاي بنيادي بالغ مزانشيمي مشتق از چربي انساني پس از القاي تمايز

همانطور که اشاره گرديد WDR5 مي‌تواند هم در کمپلکس هاي هيستون متيل ترانسفراز مختص H3K4 و هم در کمپلکس هاي بازآرايي کننده کروماتين حاوي CHD نقش داشته باشد. بنابراين پيشنهاد مي گردد ارتباط بيان WDR5 و يکي از زيرواحدهاي اصلي کمپلکس هاي بازآرايي کننده کروماتين حاوي CHD از يک طرف و همچنين يکي از زير واحدهاي اصلي کمپلکس هاي هيستون متيل ترانسفراز مختص H3K4 از طرف ديگر، در اثر تيمارهاي مورد استفاده در اين مطالعه در AdMSCs، مورد بررسي قرار گيرد، به گونه اي که مشخص گردد افزايش و کاهش بيان WDR5، که در اين مطالعه مشاهده گرديد در ارتباط با نقش آن در فعاليت هيستون متيل ترانسفرازي بوده يا در اثر مشارکت آن با فعاليت بازآرايي کروماتين مي‌باشد.
2. با توجه به اينکه در مطالعه Ang و همکاران عنوان شده که ژن Wdr5 يک هدف پايين دست از فاکتور رونويسي Nanog مي‌باشد، مي توان ارتباط بيان WDR5 و آن را در اثر تيمارهاي مورد استفاده در اين مطالعه بررسي نمود و مشخص کرد که ايا در AdMSCs بيان اين دو با يکديگر هماهنگ است يا خير.
3. مي توان با استفاده از تست Dual Luciferase assay بررسي نمود که آيا در اثر تيمارهاي مورد استفاده در اين مطالعه و در AdMSCs پروتئين HIF-1α به پروموتر ژن WDR5 متصل شده و سبب روشن شدن رونويسي از آن ميگردد يا خير. مي توان اين آزمايش را براي هرکدام از فاکتورهاي رونويسي که نقش احتمالي در بنيادينگي AdMSCs دارند، انجام داد.
4. مي توان بيان WDR5 را در سطح mRNA و پروتئين در سلول‌هاي بنيادي مزانشيمي مشتق از مغز استخوان و ديگر سلول‌هاي بنيادي مزانشيمي نيز بررسي کرد که مشخص شود آيا با الگوي بيان در AdMSCs مشابه است يا خير و ميزان تشابه مکانيسم خودنوزايي در سلول‌هاي بنيادي مزانشيمي را بررسي نمود.
5. با توجه به اينکه ژن WDR5 دو واريانت رونويسي دارد با طراحي آغازگرهاي اختصاصي مي‌توان تفاوت بيان اين دو را مشخص نمود.
6. مي توان بيان WDR5 را پس از تيمار سلول‌هاي AdMSCs با تيمارهاي شيميايي مورد استفاده در اين مطالعه، در سطح پروتئين، از طريق وسترن بلات مورد بررسي قرار داد.

بررسی میزان ماندگاری و رفتار تمایزی سلول‌های بنیادی مزانشیمی انسان در پیوندهای زنوگرافت به اندام‌های مختلف مدل حیوانی رت

نتايج حاصل از پژوهش حاضر همسو با سایر گزارش‌ها مبین قابلیت بالاي سلول‌های بنیادی مزانشیمی مشتق از بافت چربی انسانی در طب ترمیمی و درمان‌های مبتنی بر سلول می باشد.
از سوی دیگر، توجه به ماندگاری بالای سلول‌های تراریخت حاصل و نیز سرعت رشد بالای آن‌ها، استفاده از این سلول‌ها به عنوان میزبانی مناسب در تولید پروتئین‌های نوترکیب را مطرح می سازد. بر اين اساس پيشنهادهای زير براي ادامه مسير تحقيق در ارتباط با کاربری این سلول‌ها داده مي شوند.
1) بررسی توان درمانی این سلول‌ها در مدل‌های حیوانی مبتلا به بیماری‌های مغزی، چشمی، متابولیکی
2) تجهیز این سلول‌ها به ژن‌های دخیل در بیماری‌های منوژنیک و سایر بیماری‌ها و پیوند آن‌ها به ویژه به پوست و کبد مدل‌های حیوانی آسیب دیده
3) تجهیز این سلول‌ها به ژن‌های خاص نظیر فاکتور 9 و بررسی بیان آن‌ها در شرایط آزمایشگاهی با هدف تولید پروتئین‌های نوترکیب

ب) در این تحقیق سدهای خونی قابلیت تاخیر در مهاجرت سلولی، و داربست سلولی نشان از حبس پذیری بسیار بالای سلول‌های پیوندی دارد. بر اين اساس پيشنهادهای زير براي ادامه مسير تحقيق در ارتباط با سدها خونی و داربست سلولی داده مي شوند.
1) بررسی توان سدهای خونی در ممانعت از مهاجرت سلول‌هایی که توان ترشح سایتوکاین‌های تنظیمی سد خونی را نداشته باشد.
3) تغییر ترکیب‌ داربست مورد استفاده در این تحقیق به منظور دستیابی به داربستی با زیست سازگاری بالا 
2) همراه کردن داربست سلولی با سلول‌های تجهیز شده به ژن‌های خاص با هدف درمان بیماری‌های مختلف، پیوند این سلول‌ها به حیوان‌های مدل و ردیابی پروتئین تولید شده در خون.

پ) با توجه به دستاوردهای حاصل در زمینه رگزایی در این تحقیق، پيشنهادهای زير براي ادامه مسير تحقيق در ارتباط با رگزایی داده مي شوند.
1) پیوند سلول‌های غیر تراریخت به چشم و بررسی نتایج در سطح مولکولی و سلولی
2) انجام بررسی‌های ایمنوهیستوشیمی و ایمنوسیتوشیمی با استفاده از آنتی بادی‌های اختصاصی رگزایی
3) تزریق داروهای انتخابی و یا سنتتیک پیرو پیوند سلول‌های فوق با هدف غربالگری دارویی

ت) با توجه به ردیابی سلول‌های نشاندار توده ای شکل در بافت‌های مغزی و کبدی با گذر زمان، و گزارش‌های مرتبط با دخالت احتمالی سلول‌های بنیادی مزانشیمی در ایجاد سرطان، پيشنهادهای زير براي بررسی دخالت احتمالی این ‌سلول‌های در تومور زایی داده مي شوند.
1) بررسی‌ آنتی ژن‌های سطحی سلول‌های سرطانی در شرایط آزمایشگاهی و پس از پیوند این سلول‌ها در دوره‌های زمانی مختلف مبتنی بر استفاده از آنتی بادی‌های اختصاصی
2) بررسی بیان ژن‌های دخیل در سرطانی شدن سلول‌ها در سطح رونویسی و ترجمه
3) مطالعات سیتوژنتیک سلول‌های بنیادی مزانشیمی مشتق از بافت چربی انسانی در دوره‌های زمانی مختلف   

بررسی و کلونینگ قطعات با آنتی ژنسیته‌ی بالا از آلفا توکسین   Clostridium novyi تیپ A

 قطعات باقیمانده از آلفا توکسین در پلاسمید بیانی کلون شده و پس از بیان پروتئین های نوترکیب و تزریق این قطعات‌، واکنش متقاطع بین آنتی بادی تولیدی با پروتئین آلفا توکسین قرار داده شده و بهترین قطعه با میل ترکیبی بالاتر جهت استفاده در کیت های تشخیصی انتخاب گردد.
ü استفاده از یک میزبان بیانی دیگر که قرابت نزدیکتری با کلستریدیوم نویی دارد مانند باسیلوس مگاتریوم
ü تزریق پروتئین نوترکیب به حیوان هدف و مقایسه ایمونوژنسیته‌ی این نواحی
ü اتصال قطعات تهیه شده به هم و تولید فیوژن پروتئین نوترکیب‌،  بررسی آنتی ژنسیته و ایمنی زایی آن
ü استفاده از روش های بیوانفورماتیک  به عنوان یک الگو برای آنالیز سایر پاتوژن ها مانند باکتری های مقاوم به آنتی بیوتیک و ویروس ها
ü استفاده از  پپتید نوترکیب  یا آنتی بادی تولیدی به عنوان لیگاند برای خالص سازی آنتی بادی ها یا پروتئین ها طبیعی به روش  کروماتوگرافی میل ترکیبی 

بررسی و مقایسه تنوع زیستی گیاهی در منطقه‌ حفاظت شده گلول و سرانی، استان خراسان شمالی

 به دلیل محدود بودن دامنه  ی ارتفاعی نمونه برداری شده در این مطالعه، مقایسه  ی تنوع گونه  ای گیاهی در دامنه  های ارتفاعی مختلف و بالاتر نیز توصیه می  شود.
  با توجه به قرار گیری تعدادی روستا در جوار منطقه و اشتغال روستاییان به کشاورزی و دامپروری، مطالعه  ی اثر کشت و زرع بر تنوع نیز امری مفید خواهد بود.
با عنایت به اهمیت فراوان سیستم Ellenbergدر مقیاس بندی گیاهان یک منطقه با توجه به پاسخ گیاه به فاکتور  های محیطی و شرایط اقلیمی، به کار  گیری این سیستم در مطالعات منطقه  ی گلول و سرانی حائز اهمیت می  باشد.
     به منظور تعیین اثر خاک و فاکتور  های غیر زنده  ی آن بر تنوع، مطالعه و مقایسه  ی خاک منطقه در بخش  های مختلف و در دو مرحله  ی قبل و بعد از چرای دام می  تواند مفید باشد.
 با توجه به ثبت موقعیت واحد  های نمونه برداری توسط موقعیت یاب جی پی اس ، بررسی مجدد واحد  های نمونه برداری در سال  های آینده می  تواند امکان مقایسه  ی تغییرات پوشش گیاهی را در طول زمان فراهم آورد.
با توجه به رابطه  ی متقابل و غیر قابل انکار گیاهان و جانوران، مطالعه  ی تنوع زیستی جانوری منطقه و تاثیر آن بر تنوع گیاهی نیز مفید خواهد بود.
از آنجایی که منابع اندکی برای بررسی وضعیت حفاظتی گونه  ها وجود دارد، تعیین وضعیت حفاظتی جدید گونه  ها بر اساس معیار  های IUCN منطقی به نظر می  رسد.
با توجه به اینکه یکی از روش  های پارامتری تنوع، رسم منحنی   های درجه بندی  تنوع می  باشد، ترسیم و بررسی این منحنی  ها اطلاعات بهتری را در مورد تنوع  زیستی گیاهی منطقه در اختیار قرار خواهند داد.
 به منظور یافتن راهکار  هایی برای بهبود وضعیت حفاظتی گونه  های گیاهی در معرض خطر و آسیب پذیر منطقه، مطالعه  ی فنولوژی این گونه  ها پیشنهاد می  شود.

بررسی هیستومورفومتریک و رادیوگرافیک اثر سمّ دیازینون و مکمّل غذایی کلسیم بر تراکم بافت استخوان و پهنای غضروف صفحه‌ی رشد اپی‌فیزی در موش‌ صحرایی نابالغ

بررسی خواصّ مکانیکی استخوان در معرض سمّ دیازینون با استفاده از تست‌های مستقیم بیومکانیکی استخوان، مانند تست استحکام شکنندگی استخوان
2. استفاده از تست خاکستر استخوان در استخوان‌های در معرض سمّ دیازینون برای ارزیابی ارزش مکمّل غذایی کلسیم
3. بررسی اثرات سمّ دیازینون بر تکوین بافت‌های غضروفی و استخوانی در دوران جنینی موش‌های صحرایی 
4. سنجش سطوح سرمی مارکرهای پراکسیداسیون لیپیدی مانند مالون دی آلدئید، تیوباربیتوریک ‌اسید (TBARS) و کربونیل‌های پروتئینی در حیوان در معرض سمّ دیازینون
5. اندازه‌گیری چگالی موادّ معدنی استخوانِ در معرض سمّ دیازینون با روش DEXA
6. بررسی اثرات آنتی اکسیدانی ویتامین‌های E، C و کورکامین در مقابله با اثرات استرس اکسیداتیو ناشی از سمّ دیازینون در بافت استخوان 
7. اندازه‌گیری مارکرهای ساخت استخوان مانند استئوکلسین و آلکالین فسفاتاز و مارکرهای بازجذب استخوان مانند اسید فسفاتاز و N-telopeptide of type I collagen در استخوان در معرض سمّ دیازینون 
8. اندازه‌گیری میزان بیان آنزیم استیل کولین استراز در حضور سمّ دیازینون در بافت استخوانی و سایر بافت‌هایی که به طور طبیعی این آنزیم را بیان می‌کنند.

بهينه سازي شرايط القاي لانه‌گزینی (homing) هدفمند سلول‌هاي بنیادی مزانشیمی (MSCs) از طريق پيش‌تيمار و استفاده از داربست تزريق شده به صورت زيرجلدي در مدل حیوانی Rat

بررسی بیان گیرنده‌های کموکاینی دیگر و پیدا کردن محورهای گیرنده/لیگاند دیگری که به روش تهاجمی تریپسینه کردن حساس نباشند و استفاده از آن محورها در راهكار افزایش لانه‌گزینی.
2- بررسی قابلیت داربست CH-GP-HEC از نظر میزان کشسانی، سختی، قدرت مکانیکی و به طور کلی شباهت به ساختار طبیعی غضروف در شرایط in vitro و برای مهندسی بافت غضروف در مدل‌های حیوانی.
3- بررسی قابلیت استفاده از هیدروژل تزریقی CH-GP-HEC برای مهندسی بافت درجا.
4- نشاندار کردن MSCs با دانه‌های مغناطیسی و ردیابی لانه‌گزینی یا فرار آن‌ها به سایر اندام‌ها با عکس‌برداری MRI .
5- بررسي اندوسيتوز CXCR4 با ميكروسكوپ كونفوكال.
6- بررسي ميزان بيان CXCR4 با وسترن بلات.
7- افزايش غلظت SDF1 به ازاي هر ml از داربست CH-GP-HEC از ng 100 به ng 1000.
8- بررسی تاثیر راهكار ترکیبی افزایش گیرنده کموکاینی در سطح سلول و استفاده از داربست در مدل‌های حیوانی دارای آسيب‌هايي مانند سکته قلبی، ضایعه نخاعی، پارکینسون و غیره.
9- علاوه بر اندازه‌گیری کمّی تعداد MSCs لانه‌گزینی کرده، نتیجه و تاثیرات این افزایش مهاجرت از قبیل افزایش رگ‌زایی، کاهش زخم ، کاهش آپوپتوز و غیره نیز مورد بررسی قرار بگیرد.
10- ادغام MSCs در هیدروژل تزریقی CH-GP-HEC و مطالعه اثرات پاراکرین این سلول‌ها در بهبود زخم‌ها و سایر آسيب‌ها.

بهینه سازی مسیر خودنوزایی و بقا سلول های بنیادی اسپرماتوگونی جوجه درشرایط invitro با هدف انتقال ژن به اسپرم خروس

استفاده از سلول های CEF در صورت امکان جهت لایه تغذیه کننده
2- استفاده از کشت سلول  ها در ماتریکس سه بعدی
3- بررسی دیگر فاکتورهای موثر در رشد سلول  های بنیادی اسپرماتوگونی
4- بررسی ارتباط و همبستگی غلطت فاکتورها و اسپرم زایی در آزمایشگاه قبل از پیوند
5- غنی سازی سلول  های بنیادی اسپرماتوگونی قبل از تراریخت سازی و پیوند
6- عقیم سازی خروس  ها قبل از جراحی و پیوند
7- بالابردن کیفیت و کمیت ویروس  های تولید شده
8- بهینه سازی تراریخت سازی
9- مطالعه دقیق لوله  های سمینیفروس توسط سیستم  های تصویربرداری پیشرفته

تولید پلیمر پلی هیدروکسی بوتیرات توسط باکتری Ralostonia  eutropha H16  از پساب کارخانجات صنعتی

 استفاده از ترکیب چند نوع پساب صنعتی به عنوان منبع کربن به صورت سوبسترای مخلوط برای تامین  عوامل رشد و تولید PHB
2. بررسی تغییر حاصل از میدان مغناطیس بر روی تولید پلیمر PHB
3.  تولید پلیمر در فرمانتور به منظور کشت وسیع و تولید نیمه تجاری پلیمر
4. بررسی شرایط بهینه محیط کشت از جمله pH  ، میزان هوادهی و .... در حضور میدان مغناطیس
5. با توجه به ضریب قیمت سوبستراها به عنوان متغیر برای تعیین شرایط بهینه با کمترین هزینه باید مصرف سوبسترا برای تولید PHB  مورد بررسی قرار گیرد.
6. تعیین ساز و کار اثر امواج فراصوتی بر رشد سلول و تولید پلیمر PHB

تولید فیوژن پروتئین از قطعات ‌اپی‌توپی توکسین بتا و اپسیلون Clostridium perfringens

 بیان فیوژن پروتئین در سایر سیستم‌های بیانی
2. استفاده از فیوژن پروتئین یا آنتی بادی حاصل از آن در کیت‌های تشخیصی مرتبط
3. تزریق فیوژن پروتئین به خرگوش یا حیوانات بزرگ‌تر و بررسی آنتی بادی حاصل از آن
4. بررسی توانایی فیوژن پروتئین در واکسیناسیون حیوانات در برابر دوز مرگ آور اپسیلون و بتا توکسین

تهیه بیوفیلم مشتق از بافت مهندسی‌شده تاندون و مطالعه اثر آن بر تکثیر و تمایز
سلول‌های بنیادی مزانشیمی به منظور ایجاد داربست مناسب  

 بررسی تاثیر فرایند سلول‌زدایی بر سایر اجزای ماتریکس و فاکتور های رشد موجود در آن با استفاده از روش‌های ایمنوهیستوشیمی و ELISA.
2. مطالعه بیوفیلم به کمک میکروسکوپ الکترونی نگاره و بررسی بر هم کنش آن با سلول.
3. ایجاد داربست‌های سه بعدی با خاصیت الاستیسیته متفاوت به منظور شبیه‌سازی بیشتر محیط‎های طبیعی و بررسی تاثیر آن بر قابلیت تمایزی سلول‌ها.
4. افزودن سایر مواد القا کننده تمایز به محیط کشت و بررسی تاثیر همزمان بیوفیلم و سایر مواد بر قابلیت تمایز سلول‌ها به دودمان‌های استخوانی و چربی.
5. پیوند داربست‌های تهیه شده به موجودات آزمایشگاهی و بررسی زیست‌سازگاری و زیست‌تخریب پذیری آن‌ها در شرایط in vivo.
6. بررسی مارکرهای بیانی تمایز به دودمان‌های استخوانی و چربی، با استفاده از روش qRT-PCR.
7. تجاری سازی این فراورده به منظور بهره‌بری از آن در ساخت ظروف کشت.

جداسازی و شناسایی باکتری های مولد کیتیناز از ناحیه جنوبی دریای خزر

آنزیم مورد نظر به طور کامل خالص شود و عوامل مختلف بر تولید آن مورد بررسی قرار گیرد.
2- اثرات ضد قارچی آن مورد بررسی قرار گیرد.
3- می توان با شناسایی ژن کیتیناز و کلونینگ آن، به میکروارگانیسم های نوترکیبی با توانایی بالای تولید آنزیمی دست یافت.
4- ساختار سه بعدی و توالی آمینواسیدی آن مورد بررسی قرار گیرد.
5- سویه های بررسی شده، مورد شناسایی کامل قرار گیرند
6- با توجه به کاربرد زیاد N-استیل دی گلوکز آمین، خصوصا در پزشکی، کاربرد های آن مورد بررسی قرار گیرد.

جداسازی و شناسایی مولکولی گونه  های قارچ Trichoderma از خاک جنگل  های شمال ایران و بررسی فعالیت اندوگلوکانازی آن‌ها

بهینه  سازی محیط کشت از طریق بررسی منابع کربن، نیتروژن و سایر املاح و افزودنی  های مؤثر به منظور افزایش و فعالیت آنزیم سلولاز
2- بررسی تاثیر عوامل مختلف از قبیل دما، pH، رطوبت و غلظت سوبسترا بر فعالیت سلولازی و انتخاب بهترین شرایط
3- طراحی آغازگرهای اختصاصی ژن اندوگلوکاناز برای گونه  های قارچی شناسایی شده نهایی و همسانه-سازی آن  ها در وکتور و میزبان مناسب
4- بررسی هم  کشتی این قارچ  ها جهت افزایش فعالیت آنزیمی و کاهش زمان و هزینه فرایند
5- همسانه  سازی این ژن  ها در قارچ  های دیگر با تولید بتاگلوکوزیداز بالاتر مانند گونه  هایAspergillus  برای تخریب کارآمدتر سوبسترای سلولازی
6- خالص  سازی آنزیم و بررسی ساختار و عملکرد آن جهت مهندسی آنزیم با استفاده از روش طراحی منطقی و سایر روش  های مرسوم
7- شناسایی مولکولی بر اساس نواحی متغیر ITS
8- افزایش فعالیت سلولازی از طریق ایجاد جهش با استفاده از عوامل جهش  زا مانند EMS ، امواج میکروویو و تابش UV و ادغام پروتوپلاست
9- بهبود فعالیت سلولازی با بیان هترولوگ ژن بتاگلوکوزیداز در این قارچ  ها
10- بررسی شرایط مختلف برای القا، مهار و تولید کمپلکس سلولازی
11- استخراج پروتئین و اندازه  گیری فعالیت سلولازی
12- افزودن آنزیم بتاگلوکوزیداز به محیط کشت طی فرایند بررسی فعالیت  های آنزیمی
13- بررسی وجود ژن زایلاناز جدایه  ی فعال  تر و بررسی فعالیت زایلانازی آن

جداسازي، تعيين هويت و غني‌سازي سلول‌هاي بنيادي اسپرم‌ساز جوجه و بررسي پتانسيل تمايزي و اسپرم‌زايي اين سلول‌ها در آزمايشگاه

 بررسي دقيقتر اثرات کشت در آزمايشگاه بر روي حفظ خودنوزايي و يا القاء تمايز در سلو‌ل‌هاي بنيادي اسپرم ساز جوجه طي کشت و شناسايي عوامل دخيل در آنها.
— مطالعه راهکارهاي مختلف جهت افزايش حفظ و نگهداري سلول‌هاي بنيادي اسپرم‌ساز جوجه طي کشت در آزمايشگاه.
— مطالعه بيان نشانگرهاي مورد بررسي در اين تحقيق طي دوره‌هاي متفاوت تکويني جوجه و شناختن اهميت آنها در خودنوزايي و تمايز سلول‌هاي بنيادي اسپرم ساز جوجه.
— مطالعه بيان ژن‌هاي GDNF، Nanog و Stra-8 جهت بررسي و توالي‌يابي رونوشت‌هاي توليد شده از آنها.
— بررسي بيان و اهميت رونوشت‌هاي متفاوت ژن‌هاي GDNF، Nanog و Stra-8 در سلول‌هاي بنيادي اسپرم‌ساز جوجه طي دوره‌هاي متفاوت تکوين جوجه.
— مطالعه توانايي تمايزي سلول‌هاي بنيادي اسپرم‌ساز جوجه به ساير رده‌هاي سلولي.
— اعمال تغييراتي در ترکيبات و نوع ساختار سه بعدي  SACS طراحي شده جهت افزايش کارآيي اسپرم‌زايي و توليد اسپرم‌هاي فعال جوجه در آزمايشگاه.
— استفاده از روش MACS به ويژه بر اساس نشانگرهاي سطحي شناسايي شده در اين تحقيق، جهت خالص‌سازي بهتر سلول‌هاي بنيادي اسپرم‌ساز از کشت‌هاي حاصل از بافت بيضه جوجه.
— مطالعه و استفاده از ترکيبات ژني اختصاصي سلول‌هاي زاينده جنسي جوجه، جهت هدايت سلول‌هاي بنيادي ديگر از قبيل سلول‌هاي بنيادي مزانشيمي جوجه به سمت توليد سلول‌هاي بنيادي اسپرم‌ساز و استفاده از آنها براي اهداف زيست‌فناوري همانند توليد جوجه‌هاي تراريخت.
— نشاندار کردن سلول‌هاي بنيادي اسپرم‌ساز جوجه با ترکيبات مناسب همانند پروتئين‌هاي فلورسنت از قبيل GFP جهت رديابي اين سلول‌ها در محيط داخل بدن و کشت‌هاي سلولي در آزمايشگاه.
— بررسي قدرت بنيادينگي و بازگرداندن باروري و توليد اسپرم پس از تزريق و پيوند سلول‌ها بنيادي اسپرم‌ساز جوجه (نشاندار شده) به خروس بالغ عقيم شده.
— در صورت موفقيت‌آميز بودن فرآيند پيوند سلول‌ها بنيادي اسپرم‌ساز جوجه حاوي ژن خارجي (همانند GFP) و توليد زاده‌هاي تراريخت، مي‌توان مطالعات جهت توليد زاده‌هاي تراريخت براي ژن‌هاي مورد نظر و مهم جهت توليد محصولات زيست‌فناوري صنعتي و دارويي را تداوم داد.

شناسایي گنجشک سانان حوزه ی آبریز کارده با استفاده از ژن میتوکندریایي  COX1

استفاده از سایر ژن های میتوکندریایی و یا ژن های هسته ای در بررسی های مولکولی و مقایسه نتایج حاصل؛
2- مطالعه و بررسی کامل تر گونه های دارای تغییرات بیش از حد آستانه؛
3- مطالعه و بررسی جامع تر روابط فیلوژنتیکی راسته گنجشک سانان.

شناسایی گنجشک سانان زادآور شهرستان سرخس با استفاده از
ژن  میتوکندریایی COX1 و پروب  های تخصصی

استفاده از سایر ژن  های میتوکندریایی یا ژن  های هسته  ای در بررسی  های مولکولی و مقایسه عملکرد آنها
2. مطالعه و بررسی جامع  تر روابط فیلوژنتیکی راسته گنجشک سانان در شمال شرق کشور
3- طراحی پروب  های تخصصی  برای گونه  های حائز اهمیت و مورد حفاظت.

طراحی بیوراکتور تولید کود بیولوژیک بر اساس مصرف گوگرد به صورت جامد یا مصرف H2S  (با کاربری به عنوان بیوفیلتر در شیرین سازی گاز ترش)

طراحی بیوفیلتر حذف گاز هیدروژن سولفید با سیستم پیوسته(continuos) با استفاده از    باکتری  های باکتری های  A. thiooxidans و A. ferrooxidans و جدایه SOB1
2- شناسایی مولکولی جدایه SOB3
3- استفاده از جدایه  های SOB2 و SOB3 در بیوفیلتر حذف گاز هیدروژن سولفید با سیستم بسته(batch) و پیوسته(continuos)  
4- بهینه  سازی رشد جدایه  های SOB1، SOB2 و SOB3
5- بهینه  سازی فاکتورهای موثر بر بیوفیلتراسیون در بیوفیلتر حذف گاز هیدروژن سولفید با سیستم پیوسته(continuos)
6- تهیه بستر های جدید و مناسب برای تثبیت باکتریهای مورد آزمایش

مطالعه بافت شناسی تاثیر ماتریکس سه بعدی سلول زدایی شده کلیه موش سوری بر رفتار سلول‌های بنیادی مزانشیمی

بررسی میزان حفظ اجزای ماتریکس خارج سلولی در داربست سلول‌زدایی شده کلیه با استفاده از روش‌های ایمنوهیستوشیمی
2) استفاده از میکروسکوپ الکترونی جهت بررسی حذف کامل اجزای سلولی از داربست سلول زدایی         شده‌ی کلیه
3) استفاده از میکروسکوپ الکترونی گذاره جهت تایید تمایز سلولی و تبدیل سلول‌های مزانشیمی به سلول‌های پوششی دارای پولاریته و ایجاد اتصالات سلولی
4) بررسی برهم‌کنش سلول‌های بنیادی جنینی با داربست‌ کلیه سلول‌زدایی شده
5) استفاده از روش ایمونوهیستوشیمی جهت بررسی تمایز سلول‌های بنیادی مزانشیمی چربی انسان در داربست‌ها با استفاده از مارکرهایی مانند Cytokeratin و PAX2
6) بررسی ایمونوهیستوشیمی تکثیر سلولی با استفاده از مارکرKI-67
7) بررسی آپوپتوز با استفاده از کیت‌های اختصاصی

مطالعه بافت شناسی رفتار سلول  های بنیادی مزانشیمی انسانی کشت داده شده در ماتریکس سلول  زدایی شده لثه انسان در حضور هیالورونیک اسید در شرایط in vitro

مطالعه میزان حفظ اجزاء ماتریکس خارج سلولی بافت لثه پس از اعمال سلول  زدایی به کمک روش  های ایمنوهیستوشیمی
2- بررسی محتوای DNA در بافت طبیعی و ماتریکس فاقد سلول لثه
3- مقایسه رفتار  های سلولی در داربست  های با تخریب بیشتر ماتریکس خارج سلولی و داربست  های با میزان تخریب کمتر
1- مطالعه میزان حفظ اجزاء ماتریکس خارج سلولی بافت لثه پس از اعمال سلول  زدایی به کمک روش  های ایمنوهیستوشیمی
2- بررسی محتوای DNA در بافت طبیعی و ماتریکس فاقد سلول لثه
3- مقایسه رفتار  های سلولی در داربست  های با تخریب بیشتر ماتریکس خارج سلولی و داربست  های با میزان تخریب کمتر

مطالعه توجه (Attention) با نظر به تغییرات هورمون های جنسی قبل و پس از بلوغ و یائسگی در انسان

بررسی نقش هورمون LH در تکوین شبکه ی عصبی توجه در دوران بلوغ :
- در سطح رفتاری و در سطوح مختلف توجه
- در سطح نوروآناتومیکی ( بافت شناسی و سیتوشیمیایی ) در موش صحرایی
- در سطح میانجی های عصبی و گیرنده های آنها در موش صحرایی
2- بررسی نقش هورمون LH در تکوین شبکه های عصبی هنگام بلوغ در سطوح رفتاری، نوروآناتومیکی و میانجی های عصبی و گیرنده های آنها در موش صحرایی
3- موارد 1و2 برای هورمون های استروژن، پروژسترون و تستوسترون
4- بررسی ارتباط بین سطح هورمون تستوسترون و عملکرد شناختی توجه در جنس نر و ماده

مطالعه رادیوگرافیک و هیستومورفومتریک اثر سم دیازینون و مکمل ویتامین D بر بافت استخوان و پلاک رشد موش صحرایی

 سنجش چگالی معدنی استخوان  (BMD) افرادی همچون کشاورزان و دامداران و افرادی که در معرض این سم هستند.
• مطالعه اثر دیازینون بر رفتارهای سلول و تعامل سلول- ماتریکس.
• مطالعه اثر دیازینون بر سیر تکوین استخوان در مراحل مختلف جنینی.
• استفاده از مدل  های حیوانی مختلف مثل توتیا.
• سنجش سطوح مالون دی الدئید  سرم به عنوان آخرین محصول ناشی از پراکسیداسیون لیپیدی سلول  ها در بافت استخوان.
• سنجش نوسانات کلسیم، فسفر، متابولیت  های ویتامین D، پاراتورمون، هورمون  های جنسی (FSH_LH_Estradiol_Testosterone).
• سنجش نشانگر  های بیوشیمیایی تغییرات استخوان شامل استئوکلسین، استئوپروتگرین  و آلکالین فسفاتاز بافت استخوان  (مارکرهای ساخت استخوان)، و مارکرهای جذب استخون مثل انتهای C کلاژن  (CTX) و  sRANKL.
• سنجش میزان استئوئید ساخته شده توسط استئوبلاست  ها با رنگ  آمیزی Goldner. و اندازه  گیری نرخ رسوب معدنی استخوان  (MAR).
• تخمین مقدار استخوان اسفنجی که در امتداد پلاک رشد ایجاد می  شود توسط نقشه  های رنگی سه بعدی برای مشاهده کاهش یا افزایش ضخامت این ناحیه که مبین میزان کلسیفه شدن پلاک رشد است.
• مصرف آنتی اکسیدان  هایی مثل ویتامین E و C در پیش  گیری از آسیب اکسیداتیو ناشی از دیازینون در بافت استخوان.
• مصرف بیس فسفونات  ها، کورتیکواستروئیدها، مصرف هورمون  ها و ترکیب عوامل مختلف در بهبود آثار مضر دیازینون.

مطالعه مقدماتی بیوسیستماتیک خانواده Lycosidae در شمال شرق ایران براساس مطالعات ریخت شناسی و آرایه شناسی DNA  ژن COI (Arachnida:Araneae)

انجام بررسی‌های ریخت سنجی و ریخت شناسی کامل تر و رسم درخت مربوط به داده‌های ریخت سنجی و مقایسه نتایج آن با نتایج حاصل از مطالعات مولکولی.
2-  استفاده از تعداد نمونه های بیشتر و کامل تر در مطالعات مولکولی.
3- استفاده از سایر ژن‌های میتوکندریایی و یا ژن‌های هسته ای در بررسی‌های مولکولی و مقایسه نتایج حاصل.
4- بررسی رابطه پراکنش گونه‌ها با شرایط اقلیمی، میزان UV، نوع خاک، آب و هوا و پوشش گیاهی در منطقه.

مطالعه مقدماتی بیوسیستماتیک راسته رطیل ها(Arachnida: Solifugae)
در شمال شرق ایران

 انجام نمونه  برداری گسترده از تمام نقاط ایران به منظور شناسایی فون رطیل  های ایران و تعیین دقیق محدوده پراکندگی آنها.
2. بررسی بوم شناختی گونه  ها به منظور آشکار ساختن زیستگاه، اقلیم و پوشش گیاهی مناطقی که رطیل  ها در آن زندگی می  کنند.
3. تدوین یک مجموعه از رطیل  ها به منظور دسترسی دیگر دانشجویان به نمونه  های تیپ.
4. انجام بررسی  های مورفومتری و ریخت سنجی هندسی وکروموزومی به منظور یافتن صفات مناسب برای جداسازی گونه  ها از یکدیگر.
5. استفاده از سایر ژن  ها  ی میتوکندریایی از قبیل cytb و ژن  های هسته  ای در مطالعات مولکولی به منظور تعیین حدود صحیح آرایه های فراگونه  ای و همچنین تقویت بوت استرپ کلاد  های اصلی.
6.  بررسی روابط فیلوژنتیک و تعیین جایگاه آرایه  شناختی با استفاده از تلفیق داده  ها حاصل از مطالعات با رویکرد  های مختلف
7. انجام نمونه  برداری اختصاصی و کامل  تر از دو گونه Galeodes caspius و Galeodes bacillatus  و بررسی دقیق آنها با استفاده از مطالعات مختلف به منظور تعیین دقیق جایگاه تاکسونومیک این گونه  ها.

مطالعه نشانگرهای بنیادی، سرطانی و بنیادی سرطانی در سلول  های KYSE30 و بررسی اهمیت آن  ها در بیماری زایی سرطان  های گوارشی

تلاش بیشتر جهت استحصال و کشت سلول  های سرطانی مری با استفاده از روش مناسب پیشنهاد شده در این پژوهش
بررسی بیان انواع نشانگر  های بنیادی سرطانی مانند CD133، CD44 و CD15 در سایر رده  های سلولی ESCC
بررسی بیان سایر انواع نشانگر  های بنیادی سرطانی مانند ALDH1، IL-8 و BMI-1 در سلول  های KYSE30
بررسی تاثیر رتینوئیک اسید بر بیان تعدادی از پروتئین  های شناخته شده در سلول  های  KYSE30مانند SPHK1، EGFR و DNMT1
تزریق سلول  های CD44+ KYSE30 به حیوانات سلب ایمنی شده و بررسی قدرت تومورزایی این سلول  ها در شرایط in vivo
کاهش بیان CD44 به روش RNA interference و مطالعه اثرات حاصل از آن بر ویژگی  های زیستی سلول  های KYSE30
القای تمایز در سلول  های KYSE30 با استفاده از سایر عوامل القا کننده مانند والپروئیک اسید و بررسی تغییرات ناشی از آن
مطالعه و مقایسه بیان CD44 در نمونه  های سالم و توموری بافت مری با استفاده از ایمونوهیستوشیمی و real time RT-PCR
تایید نتایج حاصل از بررسی بیان SOX2 در بافت  های سالم و سرطانی مری با استفاده از وسترن بلات

تشخيص گونه‌هاي جلبكي Scenedesmus و بررسي اثرات آللوپاتي آن بر جلبك‌هاي سبز تك سلولي حومه‌ي مشهد

 استفاده از صفات مولکولی به‌منظور بررسی سطح واقعی تنوع در جنس Scenedesmus و مشخص کردن پارامترهای اکولوژیکی زیستگاه آن‌ها
§ شناسایی متابولیت‌های تولید شده توسط گونه‌های Scenedesmus و استفاده از آن‌ها به‌عنوان ترکیبات ضد جلبک در کنترل بلوم‌های جلبکی
§ بررسی اثر متابولیت‌های تولید شده بر حشرات و کاربردهای بالقوه‌ی آن‌ها به‌عنوان آفت‌کش‌های دوستدار طبیعت

بررسی پاتوفیزیولوژی کلیه در گوسفندان نر بومي منطقه آلوده به آرسنیک ارغش نيشابور

 جهت تعیین میزان دقیق آرسنیک موجود دربافتها و وضعیت پاتولوژیکی غشا فیلتراسیون، بهتر است این بررسیهای بافت شناسی با استفاده از تکنولوژی میکروسکوپ الکترونی انجام شود.
• برای مشخص شدن اثرات آرسنیک بر بافتهای کلیوی به صورت مجزا،  لازم است از روشهای رنگ آمیزی تخصصی بافتی استفاده شود.
• برای مشخص شدن تاثیرات آرسنیک بر سایرفاکتورهای خونی و همچنین اندازه گیری میزان آرسنیک خون، بهتر است بررسیهای بیوشیمیایی گسترده تری انجام شود.
• جهت تشخیص رابطه بین میزان فاکتورهای موجود در خون و ادرار و رابطه آن با میزان آرسنیک، بررسی  همزمان نمونه ادرار حیوانات نیز بررسی شود.
• نوع تغذیه حیوانات و تاثیری که احتمالا در کاهش یا افزایش مسمومیت خواهد داشت، مورد بررسی قرار گیرد.
• جهت دست یافتن به نتایج آماری دقیق تر افزایش تعداد نمونه های مورد بررسی ضروری است.

بررسی تغییرات ساختاری کلیه در جنین  های مادران هایپرگلیسمیک و اثرات تجویز مادری عصاره  ی آبی- الکلی گیاه چرخه (Launaea acanthodes) بر آن

 بررسی بیوشیمایی و فارماکولوژیکی عصاره  ی گیاه چرخه و تعیین مکانسیم دقیق تأثیر گذاری گیاه چرخه.
2- ارزیابی توان عملکردی کلیه  های فرزندان به دنیا آمده از مادران هایپرگلیسمیک تیمار شده با عصاره  ی گیاه چرخه از هنگام تولد تا رسیدن به بلوغ.
3- بررسی   آپوپتوز در کلیه جنین  ها با استفاده از کیت TUNEL assay.
4- بررسی دوزهای بالاتر و پایین  تر تجویز گیاه چرخه بر میزان قند خون مادران و تأثیر آن بر روی کلیه جنین.
5- بررسی اثرات گیاه چرخه بر دیگر اندام  های بدن جنین و همچنین بر اندام  های بدن مادر.